Komórki nabłonka wielowarstwowego płaskiego z górnych dróg oddechowych są częstą domieszką w materiałach pobranych z dolnych dróg. Zmiany zapalne w jamie ustnej mogą być przyczyną złuszczania się atypowych komórek nabłonka wielowarstwowego płaskiego, których nie należy rozpoznawać jako komórek rakowych. Raki występujące w tkankach głowy i szyi też mogą być przyczyną mylnego rozpoznania raka płuca.