V barvení dle Papanicolaoua jsou shluky mikroorganismů smíšené  s bílkovinným materiálem patrny jako zelené pěnité hmoty v alveolech. Cysty  jsou pozitivní v imregnaci; pohárkového tvaru, 5-7 µm v průměru, často s  densním centrem. V Giemsově barvení jsou patrna intracystická tělíska neboli  trophozoity jako modré tečky. Mikroorganismsy mohou být i ve vakuolizovaných makrofázích.  Přímá imunofluorecence z indukovaného sputa může být velmi přínosná.