Anatomie  a histologie dýchacích cest
      Dýchací cesty dělíme na  horní a dolní. Horní zahrnují úsek od nosního vchodu po hrtan. Dolní pokračují  tracheou do plic a představují oblast hlavního zájmu respirační cytologie.  Buňky horních cest dýchacích se občas objevují ve vzorcích z dolních cest jako  příměs. 
      Trachea a bronchy jsou  vystlány řasinkovým cylindrickým epitelem; jádro je uloženo bazálně, má jemně  granulární chromatin a densní ploténku s řasinkami na luminálním povrchu .  Pohárkové buňky jsou zastoupeny v poměru 1:6 s cytoplazmou vyplněnou hlenem.  Bazální nebo rezervní buňky, malé a nediferencované, jsou uloženy na bazální  membráně; představují prekurzory řasinkových a pohárkových buněk. Neuroendokrinní  buňky (Kultchitskyho buňky), argyrofilní, nejsou v základních barveních zřejmé;  ultrastrukturálně obsahují densní granula a znázornit je lze  imunocytochemickými neuroendokrinními markery.
      Bronchioly jsou vystlány Clarovými buňkami, které jsou kubické  až cylindrické, avšak bez řasinek; obvykle nejsou v cytologických preparátech  rozpoznány. Pneumocyty typu I jsou ploché buňky pokrývající plochu alveolů  určenou k výměně plynů. Pneumocyty typu II jsou objemnější kubické buňky  alveolárního povrchu; secernují plicní surfaktant, který je zřejmý ultrastrukturálně  jako lameární tělíska. V cytologických preparátech mají pneumocyty druhého typu  okrouhlou vakuolizovanou cytoplazmu. Někdy jsou obtížně odlišitelné od  makrofágů.
       Alveolární makrofágy mají okrouhlá nebo oválná  jádra, krajkovitou nebo pěnitou cytoplazmu s obsahem fagocytovaného materiálu (např.  prašných zrn). Ve vzorku sputa musí být alveolární makrofágy přítomny, má-li  být považován za reprezentativní.