Chlamydia trachomatis je obligatorní  intracelulární parazit, který je sdružen s tvorbou granulárních intracytoplasmatických  inkluzí. Je běžnou příčinou nespecifické urethritis a cervicitis a je odpovědná za 20%  všech zánětlivých onemocnění malé pánve a neplodnosti.  Cytoplasmatické  inkluze  se někdy objevují v nezralých metaplastických buňkách; cytologická  diagnóza je však nespolehlivá a musí být potvrzena immunofluorescenčně. Může být přítomna folikulární cervicitis.